El Instituto de Investigación de Arqueología y Antropología “Kuélap” (INAAK), de la Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, fue creado el 18 de septiembre de 2000 por Ley N°27347 junto con la UNAT-A y depende orgánicamente del Vicerrectorado Académico.
El Instituto de Investigación para el Desarrollo Sustentable de Ceja de Selva (INDES-CES)es un órgano desconcentrado e interfacultativo de la Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas, creado por Resolución de Comisión de Gobierno Nº 033-2007-UNAT-A-CG, el 07 de junio de 2007. El INDES-CES tiene como acciones esenciales priorizar la investigación en las líneas de caracterización del ensamblaje, arquitectura, funcionamiento y productividad de los ecosistemas de Ceja de Selva, priorizando los recursos naturales y culturales que constituyen la base económica del poblador regional, en la perspectiva de establecer canales adecuados del bio comercio sustentables.
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